Kooperationsklassen sind ein weiteres Angebot des MSD. Der MSD unterstützt Kinder mit sonderpädagogischem Förderbedarf in Kooperationsklassen an Grund- und Mittelschulen. Solche Kooperationsklassen werden dann gebildet, wenn Kinder als Gruppe vom Förderzentrum in die allgemeine Schule zurückgeführt werden und bei den Kindern noch ein sonderpädagogischer Förderbedarf besteht. 
Eine Kooperationsklasse kann auch für Kinder mit sonderpädagogischem Förderbedarf in der Eingangsstufe eingerichtet werden und von Beginn an die Chance bieten, im gemeinsamen Unterricht erfolgreich zu lernen. Ziel ist die Eingliederung von Kindern mit sonderpädagogischem Förderbedarf in die allgemeine Schule.