Träger der Katharina-Fischer-Schule ist der Landkreis Erding. 
Als Sonderpädagogisches Förderzentrum gewährleistet die Katharina-Fischer-Schule eine interdisziplinäre Zusammenarbeit von Sonderschullehrern unterschiedlicher Fachrichtungen, um dem individuellen Förderbedarf der Schüler entsprechen zu können. Für Eltern und Schüler wird eine breite Beratungskompetenz geboten, mit den KollegInnen der allgemeinen Schule wird in Kooperationsklassen eng zusammengearbeitet und im Rahmen des Mobilen Sonderpädagogischen Dienstes werden Schüler präventiv und integrativ betreut sowie deren Eltern und Lehrkräfte beraten. Die Mobile Sonderpädagogische Hilfe ist in gleicher Weise in den Kindergärten tätig. 

Durch die Organisationsstruktur, beginnend mit der Schulvorbereitenden Einrichtung, über die Diagnose- und Förderklassen, die Klassen 3 bis 6 (nach den Lehrplänen der Grund-, Mittel- und Förderschule) und die Klassen 7 bis 9 (nach den Lehrplänen der Mittel- und Förderschule), wird ein differenziertes Lernangebot bereit gestellt.